Montage de gènes (Image d’illustration)
Le programme de génomique africaine de Roche, l’Institut tropical et de santé publique suisse et le Centre suisse de recherches scientifiques lancent un partenariat pour approfondir la recherche génomique sur les maladies non transmissibles et infectieuses en Côte d’Ivoire, en élargissant la collecte de données génomiques pour l’étude « Double charge de morbidité » (CoDuBu).
Le Programme de génomique africaine (AGP) de Roche, l’Institut tropical et de santé publique suisse (Swiss TPH) et le Centre suisse de recherches scientifiques (CSRS) ont lancé le 14 avril 2025 à Abidjan, un partenariat visant à élargir la collecte de données génomiques pour l’étude « Double charge de morbidité » (CoDuBu) en Côte d’Ivoire. Ce partenariat vise à approfondir la compréhension des interactions entre les maladies infectieuses et les maladies chroniques non transmissibles (MNT) en utilisant le séquençage du génome entier (SGE) ainsi que des données complètes sur les biomarqueurs et l’exposition environnementale.
L’étude CoDuBu, menée par Swiss TPH et centrée sur la zone du Système de surveillance sanitaire et démographique de Taabo (HDSS), gérée par le CSRS, a été conçue pour appréhender la complexité des problèmes de santé auxquels sont confrontées les populations africaines, notamment en zone rurale de Côte d’Ivoire. Elle analyse la relation entre les maladies infectieuses, comme le paludisme, et les maladies non transmissibles (MNT), notamment l’hypertension, le diabète, ainsi que les affections pulmonaires et rénales. Comme dans d’autres régions d’Afrique, les communautés ivoiriennes sont touchées simultanément par ces deux types de maladies. L’étude intègre de manière unique la surveillance environnementale, grâce à des bracelets en silicone permettant d’évaluer l’exposition individuelle aux produits chimiques présents dans l’environnement, fournissant ainsi des données précieuses sur les facteurs externes influençant la progression de la maladie.
Des données détaillées sur l’exposome et le phénotype
Grâce à ces efforts, le partenariat permet non seulement d’introduire le SGE dans la cohorte existante, mais aussi de recueillir des données détaillées sur l’exposome et le phénotype, et de constituer des ensembles de données longitudinales. Cette approche permet un suivi continu de la santé des participants au fil du temps, plutôt que de se fier uniquement aux données de référence.
« Notre collaboration avec le programme de génomique africaine de Roche ajoute un volet essentiel de recherche génomique à l’étude CoDuBu, contribuant ainsi à combler les lacunes en matière de données sanitaires mondiales, ce qui a des conséquences concrètes sur la compréhension et le traitement des maladies dans le monde entier », a déclaré la professeure Nicole Probst-Hensch, cheffe du département d’épidémiologie et de santé publique du Swiss TPH et chercheuse principale de l’étude. « En approfondissant nos connaissances génétiques, nous souhaitons mieux comprendre l’interaction entre les maladies chroniques et infectieuses au sein des populations africaines. »
« L’équipe est également extrêmement reconnaissante de la collaboration et du partenariat avec Azenta Life Sciences, qui fournit des dispositifs de refroidissement à énergie solaire et des équipements essentiels pour maintenir l’intégrité de la chaîne du froid et la manipulation appropriée des échantillons, même dans des conditions climatiques difficiles », a ajouté la professeure Dr Nicole Probst-Hensch.
Participation de Roche AGP à l’étude CoDuBu
Les données génomiques africaines représentant moins de 3 % des données mondiales, la participation de Roche AGP à l’étude CoDuBu s’inscrit dans un effort plus large visant à remédier aux disparités dans la recherche génomique. Ces efforts sont essentiels, car la sous-représentation de l’Afrique dans le paysage mondial de la recherche a laissé de nombreuses connaissances génomiques inexplorées, impactant ainsi les résultats pour les patients et limitant les avancées en matière de santé, en Afrique comme dans le reste du monde.
Le Dr Siaka Koné, directeur du HDSS de Taabo, a souligné l’importance de ce partenariat : « Le HDSS de Taabo suit plus de 60 000 personnes depuis 2009, et l’ajout du séquençage du génome entier à nos données permettra de comprendre comment les facteurs génétiques et environnementaux contribuent aux maladies dans nos communautés. Il s’agit d’une étape importante pour la recherche génomique en Côte d’Ivoire et en Afrique. »
Ouvrir la voie à des stratégies ciblées
Grâce à cette collaboration, Roche AGP, Swiss TPH et le CSRS souhaitent ouvrir la voie à des stratégies ciblées de prévention et de prise en charge des maladies chroniques, de plus en plus souvent associées aux maladies infectieuses en Afrique. Ce partenariat devrait générer des données qui amélioreront les initiatives de santé publique et la prise en charge des patients, en mettant l’accent sur la prévention primaire et le renforcement des capacités des scientifiques africains.
L’étude CoDuBu s’inscrit dans le droit fil de l’Agenda 2063 de l’Union africaine, et plus particulièrement de son Aspiration 1, qui vise « une Afrique prospère fondée sur une croissance inclusive et un développement durable ». Pour concrétiser cette vision, il est essentiel de donner la priorité à la santé et au bien-être des citoyens africains. Ce projet génomique permettra de mieux comprendre la diversité génétique et de développer des solutions de santé ciblées et plus efficaces, adaptées aux besoins spécifiques du continent. En favorisant l’innovation en matière de prévention, de diagnostic et de traitement des maladies, cette initiative élargira l’accès à des soins de santé de qualité, soutiendra le développement durable et renforcera la capacité de l’Afrique à relever ses défis sanitaires, contribuant ainsi à l’amélioration de la santé et de la résilience des populations.
Lisa Slater, responsable du programme de génomique africaine de Roche, a déclaré : « Roche s’engage à soutenir des recherches ayant un grand impact et menées en Afrique afin de combler le déficit mondial en données génomiques. En nous associant au CSRS et au Swiss TPH, nous approfondissons non seulement notre compréhension des interactions entre maladies chroniques et infectieuses, mais nous donnons également aux scientifiques locaux les moyens de se développer et de renforcer les capacités de recherche durables en Afrique. Cette collaboration représente une avancée significative pour relever les défis sanitaires spécifiques à la Côte d’Ivoire et au-delà, avec pour objectif ultime d’améliorer les résultats pour les patients à l’échelle mondiale. »
En combinant l’expertise scientifique de plusieurs continents, ce partenariat illustre l’importance de la collaboration pour résoudre les défis de santé mondiale et favoriser l’équité en santé. La contribution de Roche AGP contribuera non seulement à étendre l’impact de l’étude CoDuBu, mais soutiendra également un modèle durable de recherche génomique à long terme en Afrique, au bénéfice des communautés locales et mondiales.
